2007～2011年度，尽管公司型创业投资企业可享用的应纳税所得抵扣额逐年增加，可享受抵扣额占应纳税所得额比例也逐年提高；但是，总体看，各年度可享受抵扣额占应纳税所得额比例，特别是各年度实际享受抵扣额占应纳税所得额比例，均较低。2011年，全国创业投资企业可享受的应纳税所得抵扣额为20.70亿元，仅占应纳税所得额的33.34%；实际享受的应纳税所得抵扣额为9.16亿元，占应纳税所得额的14.76%。可享受和实际享受的应纳税所得抵扣额占应纳税所得额的比例过低，主要是由于2008年后国家关于“高新技术企业”的认定标准显著提高，导致政策效果打了折扣。 

从投资案例看，2006～2011年度，创业投资企业投资于中小企业的占比一直保持在80%左右。但2008年以后投资于“高新技术企业”的占比很快降低到接近40%的水平。2011年，创业投资企业投资于“中小企业”的占比为78.89%，但投资于“高新技术企业”的占比仅为43.36%，所投资企业既符合中小企业标准又符合高新技术企业标准的投资金额占比仅为36.20%。